民航总医院官网显示，该院始建于1982年，2010年重新整合为民航医学中心，包括民航总医院、民用航空医学研究所、民用航空人员体检鉴定所和航空医学系培训部，是一所医教研为一体、具有航空医学特色的三级综合医院，是全国民航唯一三级综合医院，也是中国唯一一家国际航空航天医学会委员单位，下设的民用航空人员体检鉴定所是全民航唯一一家航空人员三级体检鉴定机构，是全国民航航空人员体检鉴定医师培训基地。
数据显示，2016年，民航医学中心完成了3.6万名飞行人员的健康体检鉴定以及超过3万名飞行员的心理测试数据分析，完成了华北、东北、西北地区航空人员违禁药物和常用降压药物、降糖药物的检测，为民航飞行安全监管提供了有效技术手段。
据了解，民航总医院目前职工1300余人，设有15个病区、31个临床医技科室，多个科研项目获批民航局级科研课题立项，并获得首发基金和国家自然科学基金、北京市自然科学基金的资助。医院为首都文明单位、全国百姓放心示范医院以及首都平安示范医院。
